Ajaxって、万能ではないんですよねぇ。
ブラウザで動作が異なることもあるし（「IEとFireFoxの違い（１）」）
さらに、もっと致命的（？）な弱点もあるんですよ～

それはなにかっていうと、
Ajaxで読み込んだページ内のJavaScriptは動かない場合があるってこと。
ちょっと説明し難いのですが、
Ajaxで読み込んだページ内に、
例えば「ボタンを押したら動作する」とかとは違って、
読み込んだら動作するようなJavaScriptを記述していても、
動かないのです。
これはIE、Firefox共に動きませんでした。
ちなみに、昨日はテストしていないのでうろ覚えですが、
「ボタンを押したら動作する」などのイベントに起因するものは動いた・・・と思います。
では、どうすればいいのかなぁ～と思うのだけど、
Ajaxで読み込んだページを表示する前か表示した後に、
必要な処理をむりやり実行すればいいのでは？としか思いつかなかった。
例えば、その処理をfunctionとかにしておいて、
読み込んだページの表示直後に呼び出すとかね。
読み込んだページ内で実行されなくなるのなら、
親画面（Ajaxで読み込んだページを表示させる画面）に全てのJavaScriptを用意しておき、
子画面（Ajaxで読み込むページ）はデザインだけにしておくのが良いのかもしれないですね。